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雷萌生物|血管生成實驗實驗裝置優(yōu)化和數(shù)據(jù)分析 |? ibidi μ-Slide

date:2022-02-16 10:34:13

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  不同細胞類型的細胞接種密度特征(見第 4.1.2 節(jié))


  1.介紹

血管生成實驗是篩選物質(zhì)以發(fā)現(xiàn)它們對培養(yǎng)細胞的抗或促血管生成作用的有力工具。通過比較用物質(zhì)處理的細胞與對照細胞培養(yǎng)物,物質(zhì)的效果可以通過管長和凝膠(即 MatrigelTM值)表面形成的環(huán)數(shù)等參數(shù)來衡量。

進行血管生成分析需要優(yōu)化實驗方案并建立提供可靠數(shù)據(jù)采集方法。實驗設(shè)置的三個關(guān)鍵組成部分是數(shù)據(jù)采集時間點、細胞接種密度和細胞培養(yǎng)基的血清濃度。

本應(yīng)用將幫助使用您自己的細胞系優(yōu)化試管形成分析的實驗設(shè)置,確保可靠的數(shù)據(jù)采集和可重現(xiàn)的結(jié)果。

在本應(yīng)用簡報的某些部分,我們討論了ibidi µ-Slide 血管生成,但在任何容器中進行的管形成分析都將顯示相同的特征,并且可以以相同的方式處理數(shù)據(jù)。

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µ-Slide 血管生成載玻片



  2.選擇正確實驗方案

進行血管形成分析的第一步是確定實驗方案。三個最重要的考慮因素是:

· 細胞類型——內(nèi)皮細胞中生理性地觀察到管形成

· 凝膠基質(zhì)——它需要與細胞相容,并且必須為細胞附著提供結(jié)合基序

· 培養(yǎng)基成分(要求生長因子?)

適用于大多數(shù)內(nèi)皮細胞的設(shè)置包括MatrigelTM、減少生長因子和含 2% 或更少血清的內(nèi)皮細胞培養(yǎng)基。

  3.數(shù)據(jù)分析概述

為了更好地理解優(yōu)化的后續(xù)步驟,需要對數(shù)據(jù)分析參數(shù)進行概述。

如下圖所示的顯微圖像顯示了具有四個可檢測關(guān)鍵參數(shù)管狀網(wǎng)絡(luò):

· 細胞覆蓋區(qū)域(藍色)

· 管(紅色)

· 循環(huán)(黃色)

· 分支點(白色)

可以從這些參數(shù)計算其他值,例如平均管長度、總管長度和平均環(huán)路面積。

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圖1,管形成分析的關(guān)鍵指標(biāo)


有幾種方法可以執(zhí)行圖像分析。一種方法是使用圖像處理軟件手動執(zhí)行此操作,例如 ImageJ“血管生成分析器”。

另一種選擇是使用自動圖像分析平臺,例如ACAS.

 4.實驗前工作

在開始篩選實驗之前,必要優(yōu)化實驗程序和設(shè)置。
  
4.1. 實驗裝置的優(yōu)化


細胞接種密度、數(shù)據(jù)采集時間點和血清濃度對數(shù)據(jù)值有很大影響。因此,創(chuàng)建嚴(yán)格對于生成可重復(fù)的數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)集之間的可比性至關(guān)重要。

  4.1.1. 測量時間間隔

首先,選擇細胞濃度和促進血管形成的設(shè)置來記錄時間曲線。對于人臍靜脈內(nèi)皮細胞 (HUVEC) 每孔約 10,000 個細胞,使用具有減少生長因子的基質(zhì)膠TM值和不含血清或生長因子的細胞培養(yǎng)基就足夠了。

接下來,按照應(yīng)用說明制備凝膠和細胞懸液,“ibidi µ-Slide 血管生成的形成分析”。在凝膠表面播種細胞后,立即將載玻片放入顯微鏡的培養(yǎng)室中,并開始延時記錄。每 10 分鐘記錄一張圖像,使用基于軟件的工具在每個時間點調(diào)整焦點。或者,如果您的顯微鏡上沒有孵化室,則每小時記錄一次圖像,至少在前 8 - 10 小時內(nèi)。記錄每個圖像后立即將樣品放入細胞培養(yǎng)箱中。在過夜培養(yǎng)后記錄最終圖像。

最后,分析圖像并使用合適的軟件可視化曲線。參數(shù)(例如,總管長)的時間曲線通常如下圖所示。曲線上升到最大值(約 5 小時),然后下降到平均期(約 7 小時開始),然后慢慢變平(> 20 小時)。由于所有四個關(guān)鍵參數(shù)的特征看起來相似,只評估一個參數(shù)就足夠了。我們選擇管總長度作為參數(shù),因為原始圖像提供了一個控制,可以輕松地與評估圖像進行比較。

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圖2,24小時內(nèi)管長的時間響應(yīng)



最佳結(jié)果出現(xiàn)在最大階段以及不會迅速下降的穩(wěn)定階段。在上例中,4 小時時間點和 10 小時時間點是很好的測量參考點。

  4.1.2. 細胞接種密度

要確定最佳細胞接種密度,請記錄細胞系的特征。

首先,在 5-40 x 10 3cells/ml 范圍內(nèi)進行一系列稀釋,然后將細胞接種到凝膠表面。按照第 4.1.1 節(jié)中的說明將樣品孵育確定的時間長度,并記錄相襯圖像。每個細胞濃度執(zhí)行五次重復(fù)。

評估圖像,分別在第 3 節(jié)和第 5 節(jié)中提到。將數(shù)據(jù)可視化為圖表,如下所示。數(shù)據(jù)將顯示具有最大值的特性曲線。該最大值是您的細胞類型的最佳接種密度。

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圖3,HUVEC 和 EA.hy926接種4小時后的密度響應(yīng)


4.1.3. 血清濃度

向培養(yǎng)基中添加血清可能會影響試管形成行為。在大多數(shù)情況下,血清抑制管形成。為避免此問題,請使用您在第 4.1.1 節(jié)和第 4.1.2 節(jié)中確定的條件測試不同的血清濃度,范圍為 0 - 20%。這將確定哪種血清濃度最適合血管生成和細胞存活。

  4.1.4. 放大倍數(shù)

放大倍數(shù)決定了能夠被相機成像的孔區(qū)域。由于管的形成發(fā)生在孔的整個表面區(qū)域,重要的是盡可能地對最寬的部分進行成像。如果不需要檢測細胞內(nèi)細節(jié),請使用低倍率(4 倍或 5 倍)。如果需要檢測細胞內(nèi)細節(jié),建議對每個孔拍攝幾張放大倍數(shù)更高的圖像并將它們拼接在一起

 4.2. 建立陽性和陰性對照

要創(chuàng)建陽性對照,請選擇確保血管形成的實驗系統(tǒng)(例如,具有減少生長因子的基質(zhì)膠TM值和用于 HUVEC 的無血清培養(yǎng)基)。陽性對照確保細胞是健康的,并且觀察到的任何抗血管生成作用都是由所研究的物質(zhì)引起的。

要創(chuàng)建陰性對照,請選擇一種經(jīng)證實對血管形成發(fā)展具有抑制作用的物質(zhì)(例如,用于 HUVEC 的蘇拉胺)。陰性對照確??梢砸种萍毎械墓苄纬桑槟膶嶒灲Y(jié)果提供一個比較點。

4.3. 實驗計劃和重復(fù)次數(shù)


在進行實驗之前,計算所需材料的數(shù)量,例如細胞、培養(yǎng)基、凝膠基質(zhì)和物質(zhì)。還要計算實驗室設(shè)備和空間要求以及時間表。

為了正確地進行統(tǒng)計分析,建議至少進行四次獨立實驗,每個實驗至少有 8 個單孔。所需的實驗次數(shù)取決于數(shù)據(jù)的均勻性。遵循嚴(yán)格的協(xié)議對于數(shù)據(jù)采集至關(guān)重要。

對數(shù)據(jù)集執(zhí)行學(xué)生 T 檢驗。p 值 ≤ 0.05* (≤ 0.01**) 表示該模型有足夠的功效,無需額外實驗即可繼續(xù)。

  4.4. 文檔

合理的文檔包括本節(jié)中確定的所有參數(shù)。生成一個表格圖表,其中每個實驗都記錄在一列中。附錄中給出了一個例子。

  5.數(shù)據(jù)分析

每個分析孔生成一個管長度值。然后將一個實驗(每個條件至少 8 個孔)的值相加并計算標(biāo)準(zhǔn)偏差。標(biāo)準(zhǔn)偏差應(yīng)小于 10%。這只是一個實驗數(shù)據(jù)點。 

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左圖顯示了在四個不同時間點,一種實驗條件下單孔結(jié)果的分布。右圖顯示了一種實驗條件在四個不同時間點的平均結(jié)果。

為了正確穩(wěn)定的統(tǒng)計分析,每個條件至少需要四個數(shù)據(jù)點。請記住,每個數(shù)據(jù)點由 8 個單獨的孔組成。

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單個數(shù)據(jù)點合并為一個平均值,并可以顯示在條形圖中。統(tǒng)計分析是通過學(xué)生 T 檢驗完成的,其中對不同的數(shù)據(jù)點群體進行相互檢驗。

  
6.數(shù)據(jù)解讀


學(xué)生的 T 檢驗提供了兩個單獨的數(shù)據(jù)集是否具有 t 分布值的證據(jù),表明彼此之間存在統(tǒng)計學(xué)上的顯著差異。實驗中的重復(fù)次數(shù)和實驗次數(shù)會影響分析。學(xué)生 T 檢驗可以使用統(tǒng)計分析軟件(即 SAS)或 Microsoft® Excel® 進行。

重要的是要考慮可以使用管形成數(shù)據(jù)實際預(yù)測的內(nèi)容。管的形成是一個非常復(fù)雜的過程,它結(jié)合了各種各樣的生化反應(yīng)和途徑。我們認為,該實驗裝置適用于篩選物質(zhì)并提供有關(guān)物質(zhì)抗促血管生成作用的初步預(yù)測。它沒有解釋任何觀察到的效果是如何工作的。需要額外的生化分析來確定這一點。

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